Kúpele Hajdúszoboszló sa nachádzajú na okraji známej Puszty hortobágy, na vrcholnom bode pomyselného trojuholníka Národného parku Hajdúság. Hajdúszoboszló leží v oblasti Dél-Hajdúság. Táto časť Maďarska je situovaná na severovýchod od Tisy. Mesto leží len pár km juhozápadne od mesta Debrecín. Najbližšia cesta do kúpeľov vedie cez Miskolc a Debrecín, kde treba odbočiť Szolnok. Od Bratislavy sú kúpele Hajdúszoboszló vzdialené zhruba 450 km, od Košíc asi len 210 km. Mestom prechádza aj železničná trať, spoje premávajú z Debrecínu alebo zo Szolnoku. Najbližšie letisko sa nachádza v Debrecíne.